Второй, тот что толще, должен приходить в систему охлаждения через тройник.
Вообще, у японцев есть тенденция не заводить два патрубка к расширительному бачку, и если вы не уверены, что бачёк оригинальный, то возможно у вас вариант с одним подводом шлангочки к бачку, обычно это в верхней части радиатора и как правило возле пробки для заливки антифриза, выходит трубочка диаметром около 5 мм., тогда нижний толстый патрубок от расширительного бачка просто заглушите.
И ещё, не катайтесь с неоригинальным бачком, там работа его устроена по принцыпу отдать лишнее и забрать в нужный момент, поэтому лучше найти родной бачёк и установить в штатное место, а оно обычно идёт ниже уровня радиатора и в определённом месте.
