Даже простая сигнализация подключается через замок зажигания, где питающий провод на катушки (трамплёр) (или ещё куда там идёт,) разрезается и пускается через сигналку.... в ней есть так называемый режим "симуляции неисправности", когда машина начинает просто глохнуть, но не сразу... а как бы работая с перебоями.
Возможно просто сигнализация срабатывает не правильно?
Это как правило жёлтый, и жёлтый с белым провод (алигатор, шериф) но надо смотреть мануал. Если выложишь схему подключения, или скажешь модель сигналки я подскажу какие провода.
Так же порою работает иммобилайзер (режим имитации неисправностей).